Imposible, porque no tengo ningún mensaje privado en ninguna parte
Pero de fábula, porque si visito los enlaces que me has pasado, aunque me dice "Carpeta desconocida", se me quitan las notificaciones... Ya las quité todas visitando los enlaces

gracias.
Creo que las notificaciones irán almacenadas en una tabla y al borrar los mensajes privados sin leerlos (que estarán en otra tabla), por algún bug o algo no se está eliminando la notificación asociada... No conozco muy bien phpBB, así que ni idea.
Pero vamos, que con los links se me han quitado las notificaciones, aunque no pude leer ninguno porque ya los había borrado hace un tiempo. Te adjunto una captura para que veas lo que ha pasado.