Es igual.
La herramienta no es más que un asistente que te copia el contenido de la partición de recuperación de tu equipo a un USB y lo hace arrancable. El contenido exacto que tengas en la partición de recuperación es el que se copiará, independientemente del Windows que estés usando. Si el sistema de restauración a fábrica traía Windows 8.1 lleno de mierda, el USB será lo que contendrá, aunque lo hayas creado en Windows 10.