¿No puedes girar la fuente entera para que el ventilador vaya arriba? Si tiene rejilla o aunque sea unos mm no es problema y así no molesta al flujo de la caja ni al disipador.
Darle la vuelta... pues hombre, por tirar tirará, pero no lo veo una opción para nada buena. Si ya una caja mini-Itx (aunque sea buena) no está muy bien ventilada, tienes un disipador de perfil bajo por necesidad, y encima le pones un chorro de aire caliente de la fuente encima, las temperaturas que vas a tener son feuchas.
Aparte que, aunque el rendimiento de un ventilador empujando aire o sacando aire es similar en condiciones ideales, el diseño está pensado con el flujo tal como viene, no tiene por qué cambiar gran cosa, pero cuenta con ello, y con que el aire va siempre por el camino más fácil, que será por encima del pcb de la fuente, sin tocarlo apenas. Si el aire se empuja contra él, la situación es diferente.
Saludos
