Cuando hagas la declaración, lleva el contrato de alquiler y los justificantes de pago mensuales. El de la declaración ya se encarga luego de calcular, pero si, si esta a nombre de los dos el alquiler, van a dar una parte a uno y otra al otro.
En mi caso, como mi chica no hace declaración, lo que hicimos es poner el contrato de alquiler a mi nombre y ya esta.