Usa algun software administrador de programas, como el iobit Uninstaller, estos usaran el sistema tradicional de windows y terminado usaran su propio sistema buscando archivos huerfanos y claves en el registro sin utilizar, tambien accesos directos y carpetas y te preguntara si quieres borrarlas, reinicias y despues puedes usar CCleanner, para terminar de borrar basurilla. Ya por ultimo usaria un defragmentador del registro de windows, como ainvo registry defrag, con eso ya tendras limpio y optimizado el sistema.
