No siempre son los discos, las tarjetas "gigabit" que llevan algunas placas, son "gigabit" porque sobrepasan los 100mbps de lan, pero no llegan a los 1000 ni jartas de grifa, me explico, tengo una placa zotac con un atom, tiene una realtek 8100 gigabit, y a través de ella, alcanzo los 500-600mbps, pero no más, unos 40mb/s de transferencia.
Le puse una tarjeta Broadcom dual, sacada de un servidor, y con los discos más modernos alcanzo los 80, en incluso picos de 90, los más viejos se me quedan alrededor de los 60.
Sin embargo tengo otra placa atom similar, pero inte, con phy intel gigabit (no recuerdo el modelo) que da sin problemas los 900mbps reales de transferencia, a los que les sumas las pérdidas de los protocolos dan el giga exacto.
También me preocuparía del driver de la tarjeta en cuestión, en mi caso, instalando el driver del fabricante del chipset, he ganado hasta un 200% de rendimiento con respecto al driver descargado de la página del fabricante de la placa.
Un saludo.