Pues esta muy claro, si vas a poner 4, dos metiendo y dos sacando, o incluso 3 metiendo y 1 sacando.
En el caso de que pongas filtros restrictivos, pon los que te den presion con ellos.
En cuanto a la colocacion, ten en cuenta que el aire frio tiende a caer al suelo y el caliente a elevarse, por lo que si queremos sacar aire caliente, lo mejor es poner los que sacan encima de la torre, o en la parte superior, y los que metan en la parte baja.
Por lo que veo en tu caja, puedes ponerle 5 ventiladores, dos metiendo desde el frente, dos sacando en la parte de arriba y otro en la parte trasera.
Lo ideal es que pilles 5 ventiladores iguales, y que pongas los delanteros metiendo aire y el resto sacando, aun no siendo la combinacion idonea, por asi decirlo, si es la que veo yo mas practica para tu caja.