Como te he dicho (y tú dices) deducirá IRPF si se considera pérdida patrimonial. Pero es que, que haya pagado plusvalía (Impuesto sobre el incremento de valor de los terrenos de naturaleza urbana), no quiere decir que sea pérdida patrimonial. Para nada. Son tributos independientes. Se considerará pérdida patrimonial según por lo que lo haya vendido (o haya declarado...) comparado con su valor inicial.
Un saludo.