Hasta donde yo tengo entendido, "eso que haceis en msconfig" es una "leyenda urbana", porque lo que realmente estas configurando es el numero maximo de hilos, si no lo tocas, osea si lo dejas desactivada la opcion, se permite al SO usar todos los hilos/nucleos que tenga el procesador... osea que esa opcion solo sirve para ocultar nucleos al SO, y nada mas...