Usando el encoder x264 o en si cualquier encoder a al formato h.264 usaras todos los nucleos que tenga tu sistema -actualmente el x264 reconoce hasta 16 nucleos-.
Para rotoscopio -de video- o leer archivos RAW de camaras fotograficas digitales no veras cambios, los cambios vendrian en los filtros que uses si es que estos pueden usar tantos nucleos tengan disponibles.