Pues nada instalado Windows 7 en disco duro secundario y funcionando ok.
El disco duro principal debe estar defectuoso, desde Ubuntu intenté hacer una comprobación de errores y en 2 horas iba por el 2%... el otro disco duro la hizo bien. Así pues tengo deshabitado el primer disco duro y arranco desde el segundo, parece que al encender el portátil en la pantalla del logo de MSI se queda unos segundos de más pensando, supongo que es normal, por lo demás bien.
Hablé con SAT y toca mandar todo el equipo y me dicen que creen que tardará un mes por ser estas fechas y siempre que tengan los repuestos (si no tienen ni discos duros como para pedirles una pantalla o algo más especifico...)
Estoy por seguir con el portátil un tiempo y ya tras las Navidades enviarlo, me dá hasta miedo hacerlo después de haber leído solo cosas malas del SAT.
Saludos y gracias.