Por favor, usa la búsqueda ANTES de postear, cada una de las preguntas que haces no solo están más que respondidas sino que incluso tienen hilo oficial.
El 3D se puede regular desde el mínimo (0, sin 3D) hasta el máximo, según como lo prefieras.
Hay un hilo dedicado a flashcards y a cuales son compatibles, está en la primera página y además, si miras el "mapa de 3DS" (hilo con chincheta), te enlaza a dicho hilo.
Las partidas se guardan en los cartuchos, si, y los pocos datos extra que algunos juegos requieren se guardan en la tarjeta SD.