Supongo que quieres hacerlo pero manteniendo los datos, primero eso va a tardar una eternidad y segundo todos los archivos de mas de 4gb se van a dañar, Fat32 no soporta archivos de mas de 4gb y por otra parte no esta pensado para discos duros de mas de 32gb, no digo que no funcione, pero puedes tener algunos problemas.
