NOD32 no es infalible. De hecho, ningún antivirus lo es. Y "podría ser" que tengas más porquería metida ahí que tu antivirus actual no sea capaz de detectar.
De hecho si te encontró 4 especímenes, casi me atrevería a afirmar (aún a riesgo de equivocarme) que manejas material poco recomendable en tu equipo, de modo que lo de tener algunos elementos que escaparon a la siega del antivirus es la explicación más verosímil para mí.
¿Qué haría yo? Hacer copia de respaldo de todos los documentos personales o cosas importantes, recopilar drivers y programas que vaya a necesitar después, ... formateo a bajo nivel a destajo y reinstalación desde cero.