Umm a ver si te puedo ayudar, aunque no te entiendo muy bien. Cada uno, en principio, va a tributar por su parte, por la parte que se le va a imputar. Es un poco dificil desde aquí, pero yo he visto, y es muy habitual, ver el impuesto de transmisiones patrimoniales a nombre del comprador (marido) entero, a pesar de que lo compra en gananciales con la mujer (obviamente, en ese caso hay que hacer 2 modelos 600 cada uno por la mitad del valor).
Yo creo que el gestor os ha presentado los modelos todos iguales, pero hay que decirle que de eso nada, que la base imponible de cada heredero no es exacta a la del otro.