Los juegos y programas instalados en la partición del disco duro donde también tienes instalado el sistema operativo si los perderás.
Es decir, que si en C tienes instalado el Windows 7 de 32 Bits, y además instalaste ahí los juegos y programas, date cuenta que al querer meterle el de 64 Bits primero hay que formatear esa partición del disco duro, con lo cual te cargas todo lo que tenga.
Así que lo mejor será buscar otra partición para dichos archivos, juegos , programas, etc..., la cual no vaya a ser formateada.
Saludos