A ver. El emulador está basado en sistemas *nix, así que en windows va, pero no todo.
La última vez que leí la doc (v2.0) decía que funcionaba todo excepto el NDK (Native Development Kit). Para poder desarrollar apps nativas (y no java) en windows, o al menos para sacarle todo el partido, necesitas instalar una shell *nix,: cygwin. Si mal no recuerdo había instrucciones al respecto
Por lo demás que yo sepa funciona todo perfecto en windows.
