Con Total Commander puedes, aunque por defecto ordena las carpetas por nombre sin atender a otro criterio. Suponiendo que lo instales para cambiarlo tendrías que entrar en Configuración - Opciones - Pantalla y donde pone "Orden de directorios" marcar la casilla "Como ficheros". Después puedes hacer que muestre el tamaño de las carpetas pulsando Mayúsculas + Alt + Intro (o pulsando Espacio encima de las que quieras y que sólo muestre el tamaño de ésas) y ordenar por tamaño pulsando Control+F6 o también desde el menú Ver.