A ver, son dos cosas distintas. Lo que dice ese mensaje, es que en el inicio (en la pantallita que sale al arrancar) aunque tengas 4Gb instalados (el máximo que admite tu tarjeta) pueden mostrarse menos dependiendo de la configuración de tu PC, esto es independiente del SO que tengas instalado. Dice que el sistema se reserva una cantidad para dispositivos en el arranque que no se muestra, sencillamente.
Luego, efectivamente, si tienes un SO de 32 bits, este podrá usar sólo 3,25Gb que es el límite, con un SO de 64 bits podrás usar los 4Gb y no más porque tu placa no admite más.
