No sé los demás pero yo no he entendido nada de nada.
Edit:
Así mejor. No uso eso así que no te sé decir, pero si usas compiz (ya me parece que lo usas porque lo necesita ese programa), tal vez la solución sea retrasar su aparición unos segundos, como sucede con otros programas como conky.
Haz un script así:
#!/bin/bash
sleep 5s && cairoclock
El 5s lo puedes cambiar por el tiempo que quieras, si ves que se soluciona y tu ordenador carga rápido puedes poner 3s o como veas. Si no te va, prueba a poner 10s, y si no te va pues es que ésta no es la solución

Cambia "cairoclock" por el comando que lanza el programa, que no sé cuál es.
Lo guardas como cairo.sh o como prefieras, le das permisos de ejecución, lo guardas donde quieras y lo pones en lo de aplicaciones al inicio (quita el otro que tenías puesto). Y ale, a probar suerte.
Por cierto, esos errores que has puesto no son errores, son avisos.