un disco duro solo se para si esta ativado que separe al cabo de X tiempo sin usar el PC,
ademas un HDD trabaja continuamente, si tienes XP o Vista, siempre esta moviendo cosas, si desfragmentas un HDD en activo a los 5 min ya habra muchos archivos fragmentados, el HDD nunca para de trabajar y mas si tienes muchos programas,
mira, abre el administrador de tareas y ve a procesos, eso te mostrara todos los programas que posiblimente casi todos esten accediendo al HDD.
SALU2