Tan solo tienes que tenerla actualziada con el firmware que incluya cada juego, creo que los Wave3 incluyen la NXE como actualización en el disco, y es lo que se elimina para que funcione en firmwares iXtreme 1.5 o inferiores.
Parchear los juegos tienes un alto riesgo de que te baneen online, aunque es la solución mas facil para jugar, yo te recomendaria actualziar el firmware del lector a 1.6 que, ademas de leer los Wave3 correctamente, creo que tiene mejoras de seguridad.