El core 2 duo es mejor, porque si comparamos el "clock por clock" es decir frecuencia por frecuencia es muchísimo más rápido que el pentium d y si lo subes un poco de frecuencia ya ni te cuento, además mucho más fresco. Si el cambio te sale gratis hazlo sin pensar. Si no pues ve leyendo comparativas en páginas de hardware.
saludos.