Yo lo que hice cuando me pasó es cabiar el disco duro de un ordenador a otro, sin quitar nada, lo que pasa es que despues te dan mil conflictos y es un poco chapuza, simplemete quita los drivers anteriores cuando hayas metido ya tu disco duro en el ordena nuevo. Yo te recomendaria formatear pero si no quieres hacerlo intenta esto.
De todas formas si lo que has hecho es actualizar tu ordena a uno mejor, y tu disco duro es de entrada PCI te recomiendo que compres un disco duro nuevo un SATA2 ya que la diferencia de rendimiento es impresionante, y ademas podiras dejar este disco duro como secundario y que yo sepa en los emuladores no pasa absolutamente nada en utilizarlo desde un disco duro que no sea el principal.
Bueno lo demas es cosa tuya, espero que te sirva mi consejo.
Otra cosa: a ver creo que los emuladores al menos los que he utilizado yo, no creo que tengas ningun problema en pasarlos a un cd que te guarden la configuracion con copy paste simplemente. Formatear el ordenador y despues volverlos a meter, esto no funciona en todos los programas, de hecho no funciona en casi ninguno, xo en los emuladores que yo he probado si que funciona.