No caigo en ninguno..., pero tal te pueda ayudar cojer y abrir por carpetas todas las web (abrir todos los marcadores de dentro me refiero) y asi seguro que puedes clasificar y eliminar el triple de rapido ^^. Eso si, te recomiendo para hacer esto un navegador estable y tener mucha ram, calculo que 1GB de RAM por cada 40 pestañas mas o menos ^^, en mi caso utilizo Gogle Chrome.
Y si usas Firefox, puede que exista un plugin para ello.
Otra opcion es que exportes el historial y utilices otro soft para analizar sus enlaces..., asi a lo tonto Jdownloader comprueba si los enlaces existen, y es bien facil hacer copy/paste del codigo fuente de una pagina web exportada ^^.
Programa especifico no conozco, pero asi al menos el trabajo se te puede hacer mas llevadero al comprobar paginas de 20 en 20 o mas.
