Puedes ocultar la barra de tareas simplemente poniendo el cursor del ratón sobre ella, botón derecho/propiedades/ocultar automáticamente la barra de tareas.
Así, siempre que no la estés usando, ésta desaparecerá dejando el escritorio totalmente limpio. Para volver a verla, solo tienes que llevar el cursor arriba del todo de la pantalla y te aparecerá de nuevo.
En esa misma ventana tienes también otra opción, llamada conservar la barra de tareas siempre visible, que si la desactivas te tendría que quedar la barra por debajo del programa y no al revés, como te pasa ahora. No sé, vete probando con las opciones que tienes ahí.