lo primero que tienes que hacer es identificar lo que se le llama IDE0 e IDE1 que son las entradas donde conectas los discos duros y las unidades de cd.
tambien identificar la de los discos Sata
despues procedes nombrar un disco como maestro y el otro como exclavo... esto lo haces moviendo el jumper que viene junto al cable de corriente o de datos.
como los dos discos tienen windows (imagino)tendras que elegir uno... para que sea el que inicie. (maestro)el que tienes ahora.
una vez todo conectado... al entrar a windows solo seria cuestion de ir a mi pc para ver si te detecto ambos.