MIS OJOS!!! (barra azul windowsera).
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Poco toco iTunes (uso para escuchar ToolPlayer) pero lo poco que lo he tocado (ayer estuve ordenando mi colección musical), nunca me ha pasado eso.
Irónicamente, SI me pasaba en el curro con Windows Mier... ejem, Media Player 11 y nunca encontré la razón. La única solución fue mover manualmente el tema al álbum correspondiente.