posiblemente el archivo tenga atributos de oculto y sistema, y tu no tengas la opcion mostrar esos archivos, por lo que no es que Vista te lo borre o pierda, esque tu no lo ves...
Abre "Equipo" (mi pc), en la barra selecciona Herramientas>opciones de carpeta, y en la pestaña "Ver", marca la opcion "mostrar todos los archivos y carpetas ocultas" y despues el boton aceptar.
Es una cosa muy tonta, pero no se tu nivel con los ordenadores...
y puede ser eso.
Saludos