Estas gomas están porqué el core está a la vista y no va encapsulado como van ahora. Sirve para no "aplastar" el núcleo cuando pones el disipador.
No se que pasaría si pusieras el disipador sin estas gomas, pero igual te cargas el procesador.
Tendrás que buscar algo que haga la misma función (mismo grosor).
Saludos