Muy buenas, prueba dos cosas, la primera de ellas pasarle el hdd regenerator a ver si te arregla los errores (te llevará bastantes horas, eso sí) y la segunda es conseguirte el "irensboot" (no puedo poner el nombre real por tema legal, pero buscalo en google y te ayudará con su enorme sabiduria xD) y en él se incluye el programa COPYR.DMA , que te permite clonar un disco duro con errores en otro, eso sí, necesitas que el otro disco duro esté vacío, porque te va a pasar la información saltándose los errores....
saludos