No entiendo exactamente lo que te pasa ¿¿a veces te muestra frases de los subs y a veces no??. Eso no es posible, si es asi el archivo de los subs esta mal creado ¿lo has revisado?. Sino, también puedes probar con el reproductor Bsplayer (en mi opinion mas eficiente al manejar subtítulos).
Salu2.