Puede ser una perogrullada pero... ¿tienes drivers de tu ratón?
Yo uso un Razer Diamondback edición plasma (más bonito él ^^) y no hay manera de que funcione la rueda hasta que no le meto los drivers.
Si tienes un ratón algo más cutre prueba a ver si te funciona la rueda, si sigue sin ir es cosa del juego.