Podrias formatear desde el disco de instalacion de VISTA o desde windows VISTA, si quieres formatear desde WinXP y XP esta instalado en C: pues es logico que XP no te permita darle formato a la particion donde esta instalado.
Ahora, al formatear C: perderas los archivos del Administrador de Arranque, tu sabes, esas opciones que aparecen tras prender la maquina y pregunta que Sistema Operativo quieres que inicie cuando tienes mas de un Sistema Operativo instalado.