Pues si, es la mejor opción, desde luego si quieres que vaya todo bien, y sin problemas una reinstalación puede no bastar (aunque no pierdes los programas) y si ya tienes que ir a un formateo, lo ideal es empezar de 0.
Además, personalmente, no me gusta tener muchos programas metidos, los voy instalando según los necesito, total en una tarde lo tienes todo.