Pon el HD nuevo solo.
Crea las particiones q kieras, formatea, instala el S.O. y todo lo demas.
Luego pon el HD de 60 como esclavo(da igual si tiene un S.O. instalado), el ordenador booteara desde el HD nuevo(recuerda poner en la BIOS el primer boot como IDE-0, HDD, etc.., vamos,q bootee desde el HD).
Pasa la informacion q kieras desde el HD de 60 al nuevo(mas bien, a la particion) y listo, formatea(desde el propio Windows, en MiPC, boton derecho encima del HD y Formatear....).
El HD de 60 lo dejaria sin particion alguna, para los P2P o archivos importantes(al nuevo si hazle particiones).
Y listo.
P.D.: El formato en NTFS.