Igual no te alegra lo que te voy a decir pero en parte te tranquilizará, supongo. Me temo que es algo normal, yo todas las veces que he oído algo desde la entrada de linea, sea en tarjeta de sonido externa como integrada, se oye estéreo quizás porque las tarjetas pasan el sonido directamente a los altavoces sin transformarlo en surround como pasa con ficheros de música.
Solución no conozco, igual algún aparato decodificador pero desconozco si se podría aprovechar.