Principalmente, el Socket donde se conectan.
Uno requiere una placa con Socket 939, que usa memoria DDR, mientras que el otro va conectado en Socket AM2, que usa DDR2.
A día de hoy no notarás una diferencia sustancial entre ambos, de ahí que tengan un precio aproximado. Con la memoria tampoco, ya que el incremento de velocidad que te puede ofrecer la DDR2 se pierde con las elevadas latencias que llevan.
Saludos