Yo diria que si que afecta, que el estado de fragmentacion del disco duro es critico en los resultados.
Yo tengo mis discos duros llenos de particiones (De la epoca en que no me convencia el NTFS y para evitar tamaños grandes de cluster en FAT32 hacia particiones de solo 16 GBytes).
Por ejemplo en mi disco duro de 120 GB tengo 6 particiones de 16 GB y una de linux. En el de 80 GB tengo 8 particiones de 8 GB y una de 11 GB
Bueno pues el PassMark PerformanceTest que te recomende da resultados muy distintos segun la particion en la que se pruebe, en particular los resultados de la particion C: son penosos (es la que mas fragmentada debe encontrarse)
No se si sabras que el rendimiento de un disco duro depende de la posicion de los datos, asi las mayores prestaciones se consigen en los primeros sectores y las peores en los ultimos, llegando a ser casi el doble de rapido en los primeros.
En mi caso en teoria el rendimiento deberia ser mayor en la primera particion y peor en la ultima, sin embargo no era asi, el resultado no era regular y yo lo achaco al estado de fragmentacion de las particiones (hace dos años que no desfragmento)
Podras comprobarlo en este link sobre rendimiento de discos duros de Tomshardware:
Observa el diagrama de rendimiento en funcion del eje OX de la zona del disco duro y veras como es estrictamente decreciente:
http://www.tomshardware.com/2006/02/06/wd1500ad_raptor_xtends_performance_lead/page9.html
Aqui un link para comparar distintos discos duros:
http://www23.tomshardware.com/storage.html
Si quieres rendimiento traslada el sistema operativo al disco duro nuevo que sera mas rapido.
Suerte y no te obsesiones
