Pues hay alguna placa que es agp y pcie, q recuerde ahora una Asrock que ademas era muy barata. Aunque por lo general, vienen con solo uno d los dos puertos. En los pcie no podras conectar agp y viceversa. Un Saludo.
Como bien te dice tioldo, no puedes. Actulamente solo conozco una marca de placas base que tenga AGP y PCI-E, que es ASROCK, la cual es la 2º marca de ASUS. Son excelentes placas y son baratísimas para lo que ofrecen, superando a placas más caras.