Hola, por norma general los SATA son mas rapidos que los IDE entonces, los ides mas antiguos iban desde ATA66 o menos hasta los discos ATA133, Las unidades opticas si van a ATA33 o ya las DVDRW mas.
Los SATA van mas rapiditos, a unos 150mb/s para el SATA1 y el SATA2 a 300MB/s, son discos mas rapidos, por tanto si tu placa soporta SATA, mejor que el ide pontelo, deja los ide como almacen o secundarios, en el SATA mete el SO.
salu2