A ver, thunderbird mediante un programa llamado hotmail popper o freepops te permite descargar los emails de la bandeja de entrada de hotmail, pero yo lo que buscaba era si podía descargar los de las carpetas que creas tu mismo para tener más ordenados los emails, de todas formas ya me enteré en el foro de thunderbird que no se puede, porque solo te deja descargarte los de la bandeja de entrada.
Gracias de todas formas.
PD: Outlook ya no te deja descargarte los mensajes de hotmail si no tienes una suscripción de pago.