tu pregunta es si lo de "proceso inactivo de sistema" es un troyano o algo, no?
bueno, si es así, decir que, como dice su propio nombre, no es más que los recursos libres (o inactivos) que tiene el sistema.
por tanto, cuanto mayor sea el porcentaje de éste, pos mejor (creo que no hay mucha duda posible, verdad?

)
eso sí, he visto por ahí un par de procesos bastante chungos, creo que eran los de "IEXPLORE.EXE"
en cuanto al mejor antitroyanos, pues no sabría decirte, puedes probar con el "trojan remover" o el "antitrojan", aunque si puedes evitar que entren con un firewall (kerio, por ej) y cambiando el navegador (firefox, por ej)), pues mejor que mejor.
saludos