edita el boot.ini (con cuidao que es de sistema) y veras una linea mas o menos como esta por cada una de las opciones que te salen en el arranque del equipo
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional" /fastdetect
Bien, pues para quitar la que no deseas primero verifica que no es la que viene como default= y borra esa linea.
Un saludo