Windows 98 te mostrara otra unidad de disco duro si la bios la detecta como ya te han dicho. Ademas, si solamente quieres un disco duro mas, pues ya no tendrás que hacer nada ya que aparecera como otra unidad (quizas no sea necesario ni formatear), peeeero ojo!!!!! que a veces te añade la letra de unidad posterior a la del cd-rom pero eso se puede cambiar.
Si quieres despues crear particiones en ese disco duro yo no usaria el comando Fdisk a menos que sepas como va, porque si no lo conoces quizas sea complicado eso de cambiar de un disco a otro y demas. A veces, si n querer, usando dicho comando se acaba quitando las particiones del disco que funciona y ...............
Mejor si despues quieres particionar el disco usa programas como el Particion Magic, que es facil de usar y muy grafico.
Salu2