tienes que modificar el archivo /etc/X11/XF86Config-4 si usas xfree. Para saber que poner o quitar en el readme de los drivers de nvidia tendras toda la informacion, puedes encontrar el readme en la pagina de nvidia o /usr/share/doc/NVIDIA_GLX-1.0/README .
Para que te sirva de ejemplo, esto es parte de mi XF86Config-4 donde configuro la salida de tv y el cursor shadow (esto ultimo y algunas cosas de la salida de tv configurable desde el programa nvidia-settings que los mismos drivers te instalan):
Section "Device"
Identifier "device1"
VendorName "NVidia"
BoardName "NVIDIA GeForce FX (generic)"
Driver "nvidia"
Option "DPMS"
Option "CursorShadowYOffset" "2"
Option "CursorShadow" "true"
Option "ConnectedMonitor" "CRT,TV"
Option "CursorShadowXOffset" "4"
Option "TwinView" "true"
Option "SecondMonitorHorizSync" "30-50"
Option "MetaModes" "1152x864, 1024x768
@1152x864; 1024x768, 1024x768; 800x600, 800x600; 640x480, 640x480;"
Option "SecondMonitorVertRefresh" "60"
Option "TVStandard" "PAL-B"
Option "NvAGP" "3"
Option "TwinViewOrientation" "Clone"
Option "CursorShadowAlpha" "64"
EndSection
Por cierto, en la busqueda avanzada del foro encontraras mas info.