Con HandBrake vas a tener que recodificar, lo cual es lento y siempre se pierde algo de calidad, al menos en el vídeo, los audios y los subtítulos se pueden copiar (passthrough).
Te sugiero que uses mejor MakeMKV, que solo extrae las pistas que tú le indiques (puedes eliminar p.ej. los vídeos, audios y subtítulos que no quieras) y es bastante sencillo de utilizar (si no te aclaras, siempre puedes usar Google y buscar tutoriales, etc...) además que es gratuito y puedes bajar desde la propia web del autor una key gratuita (que suele durar un par de meses normalmente) si quieres:
https://www.makemkv.com/download/https://www.makemkv.com/forum/viewtopic.php?f=5&t=1053El único inconveniente que puede surgir es que, cuando vence la clave (como ha sucedido p.ej. con la última versión hace unos días) puede que el autor esté muy ocupado y no publique en su web una nueva key gratuita durante un par de días, pero no se suele retrasar más normalmente y a caballo regalado...

o si lo vas a usar mucho, mucho y te interesa, puedes comprar una clave vitalicia si quieres.
Otra ventaja de este software es que remueve la protección de los discos, a mi al menos no me ha dado problemas nunca y siempre se ha saltado las protecciones anticopia.
Ah, que se me olvidaba, si en vez de usar un disco usas una ISO, también sirve.
Saludos.