Supongo que el SSD es del de 500GB.. si, windows está en el otro (2TB).
No es nada complicado en serio,
Apaga el pc, abre la tapa lateral, y el HDD, lleva 2 conectores sata, uno que va a la placa, y otro que va a la fuente, desconectando cualquiera de los dos el pc no te lo reconocerá. (el sata de la placa lleva un pulsador para que salga, el de la fuente va simplemente metido y ya)
Entonces cuando ya tengas windows instalado y en orden, apaga el pc, conecta el hdd y listo. Solo te quedaría formatear el HDD para no tener 2 windows