Si quieres hacer eso podrías hacer dos cosas...
a) Usar la consola de recuperación puedes entrar con el cd de windows xp y entrar en la consola de recuperación, el entorno es similar al de MS-DOS, con el que puedes reparar el sistema.
b) Como desde el xp es imposible crear discos de arranque en condiciones, usa algún pc que tenga un SO basado en MS-DOS (windows 9x y ME), o sino mira en internet que hay páginas que te dejan bajarte programitas para crear discos de arranque de otros SO más antiguos (yo adoraba el del 98 SE), una vez que tengas estos, para arrancar desde el disquette solo tienes que asegurarte de que tu BIOS está configurada para ello, o modificarlo en caso contrario, y con esto puedes usar fdisk y format a tu gusto, aunque debes recordar que el DOS sólo puede trabajar con particiones FAT, el resto ni las ve.
Además, podría haber una tercera opción...
c) Si ya tienes un poco de maña con el DOS, puedes crearte tus propios discos de arranque para optimizar así la memoria que usas... es algo muy aburrido.