Sí, pero tendrías que desmontar esa partición para formatearla. Ya que no es la del sistema, en teoría deberías poder, pero no sé cómo va el rollo de particionamiento en Windows. Sé que en Linux se podría desmontar, en Windows ni idea. Si no puedes, tendrías que arrancar con un sistema Live (una distribución GNU/Linux) y usar Gparted para borrar la partición y crear lo que quisieses, organizar tu disco como quieras, etc.